迫害和平静的时期
20世纪90年代，浙江省的信徒聚集一起为一名教会成员举行哀思礼拜。
进入20世纪90年代后，浙江省的基督教会继续全速增长。在这个十年之初，该省估计有300万名福音派信徒，政府深感震惊，尤其是教会开始向中国的其它地方差派传道团队。
为了消除教会不断扩大的影响，当局采取了不同的措施，20世纪90年代的特点是，一会儿迫害非常剧烈，一会儿又相对平静。基督徒学会了警惕，辨别最近处于哪个时期，并相应地调整他们的行动。
自20世纪80年代中期以来，温州市的教会相对比较平安，他们借助这段和平时期建造了数以百计的新教堂，有些教堂的设计非常精致，与欧洲的大教堂相仿。然而，事情即将发生巨变，在这十年快要结束时，数百座类似的教堂被愤怒的政府夷为平地，当局决心阻止基督教的发展。
温州市的局势在1991年9月出现了意外转折。当时，来自几间未注册家庭教会的两千名基督徒参加了一个大型的洗礼聚会。目击者说，聚会的时候，
“一大群公安人员突然冲进教堂，并朝天开枪。一些公安跑上讲台，殴打主持聚会的牧师。几名牧师被逮捕，并被关进拘留所。
家庭教会的基督徒对这次无缘无故的袭击感到惊讶和愤怒，因为它是在没有搜查证或逮捕令的情况下进行的。一大群当地基督徒去温州市公安局抗议袭击和逮捕，但当局否认对此事知情。几名在袭击中受伤的人的身体状况非常糟糕。”
三自教会的复兴
宁波市三自教会的敬拜者
20世纪90年代，浙江省开始出现了一个新的动态，这让当局和许多人都大吃一惊。政府曾花费了很多的时间和精力设法诱导基督徒服从三自教会的领导，数以百计的教会已经注册。如果政府认为这些教会的属灵生活和活力将会被抑制住，那就大错特错了。
万王之王拒绝让他的祝福只局限于浙江省的某一类信徒身上，圣灵的风也开始大能地吹向三自教会。许多注册的教会都爆发了复兴，伴随着无数的医治和其它奇迹，有成千上万的人得救。
浙江省的三自教会因低报三自教会的人数而出了名——也许是不想引起北京当局注意到教会的真正规模和影响——但即使根据官方的消息来源，也显明浙江省三自教会受洗的成年会员人数出现了显著的增长，从1990年的90万增加到1994年的120万，1997年增长到了130万。
此外，浙江省天主教会也以惊人的速度增长。之前对该省天主教徒进行可靠调查是在1937年，显明当时浙江省共有100236名信徒。时隔半个多世纪后，中国社会科学院估计，到1992年，该省的天主教徒已经增长到了70万。
小群教会的复兴
小群教会是由倪柝声创立的。她于20世纪30扩展到浙江省并获得了蓬勃发展，尤其是在浙江省的北部地区。这个教会运动的正式名称是“地方教会”，但许多基督徒称其为“小群教会”，因为他们聚会时使用一本名为《小群诗歌》的赞美诗集。”
政府对该教会运动表现出这样的力量以及她的成员如此合一感到很困惑，1995年，一名学者被派往湖州市调查这一现象。他的报告极具启发性。他写道：
“1982年至1989年间，湖州地区的基督徒人数增长了六倍，大概有25000人。我们访问了小群教会成员所居住的村庄。他们承认，他们不像浙江省南部的基督徒那样受过良好的教育，在浙江省南部，基督教已经有一个多世纪的历史，相比之下，湖州地区的基督教历史只有十年。但是，‘苦难生恩典，’他们自豪地告诉我们，他们的灵性发展比那些生活在物质富裕地区的人要高。简单而言，他们相信祈祷的力量，信徒必须‘凡事祷告’。
祷告的时候，他们经历到圣灵的充满，引导他们的言行。为了使某个人得医治，几个（有时是几十个）村民会聚集在一起，禁食祷告好几天。
起初，湖州市的小群教会是三自教会的一部分，但在1985年，由于诸多的差别，他们决定分开。今天，他们对三自教会的怀疑和缺乏信任，体现在他们相信教会的头是耶稣，而不是任何人。教会不应该由政府领导，但三自教会非常傲慢，对圣经无知，在道德上不够严谨。
在杭州附近的萧山区有八万名基督徒，其中七万名属于小群教会。他们认为爱国应该体现在工作岗位上，而不是体现在教会中，所以，他们拒绝加入三自教会。”
有这样坚实的圣经基础，加上热心为神做工，浙江省小群教会的信徒开始向中国的未得之地差派宣教士，这一点并不令人意外。从1991年1月开始，小群教会的许多成员感到基督的再来是迫在眉睫的事。有一份报告说：
“经过恒切的祷告后，有几个人去到广西区和湖南省传道。不久，他们带着好消息回来，说有几十人归信了基督。这大大地激励了萧山区几十间领受到传福音异象的家庭教会。每间教会都派出七八十名年轻基督徒。他们大多数是农民，是家庭的支柱，但他们乐意奉献自己的工作时间和收入去传福音。
1991年3月，他们两个两个地被差派到湖南、山东、江苏、四川等省份及中国的其它地方。那些留在家里的人则全心全意支持这些年轻的传道人。他们建立了24小时祷告链，由12个祷告勇士组成，两人一组，每组每天祷告两个小时。”
小群宣教士取得了非凡的成功。1991年5月，一分来自萧山区的报告说：
“似乎弟兄们一开口讲道，听众就表达出接受基督的愿望。仅仅几天之后，一对传道人报告已经有300人归信基督。来自一个家庭教会的24名传道人回来后，报告称有1300人接受了救恩。这是神的大能，不然，这么少的传道人怎么能让一千多人信主呢？
来自另一间教会的年轻传道人以前从来没有这样传过道，所以，他们到达目的地后，就跪下来虔诚地祷告，然后他们向旁观者传道，第一天就有40人相信耶稣。第二天又有200多人相信。
到1991年5月底，大多数传道人都回到了浙江省。虽然没有直接的统计数字，但他们估计，经过两个月的传道，已有超过一万人得救。萧山区的家庭教会继续差派工人去做牧养和跟进的工作。年长、有经验的弟兄也被派去主持洗礼，监督教会的建立。”
成长的痛苦
20世纪90年代，随着福音的传播，浙江省各地持续发生各种神迹。甚至小孩子都传讲福音，并看见圣灵大能地做工。据报道，在杭州市附近的一个村子里：
“一个八岁的基督徒男孩正和他的小邻居玩耍，邻居无意中用一根尖尖的竹竿戳了他的眼睛。男孩的左眼失去了视力，他和家人都非常悲伤，刚开始，他们无法原谅他们的邻居。然而，通过祷告，饶恕的灵充满了他们的心，几个星期后，男孩的视力恢复了。全村的人都对他的意外痊愈感到惊讶，许多人因为这个见证而接受了耶稣为他们的救主。”
在浙江省的另一个地方，一个患有严重心脏病的男人花尽了所有的钱财看病买药，但他的身体不但没有好转，反而每况愈下。有一天，他听到有人说凡相信耶稣基督的人就会得永生。意识到自己很快就要死去，他凭着信心让人开车把他送到信徒的家里。听到福音后，他忏悔自己的罪，将生命交托给了神。
那天晚上，基督徒们轮流热切地为他祷告，七天后，他感到神已经医治了他。他就回家去，预备自己的家，把它作为神百姓聚会的地方。为此，那个村子90%的人都归信了基督，几个星期后，就有200人定期在他家里聚会。
尽管有许多证据表明神正向浙江省的百姓浇灌下恩典和怜悯，但教会面临着许多重大的挑战。最迫切的需要是他们中间缺乏训练有素的圣经教师，这威胁到复兴的进程。
农村家庭教会的聚会经常没有教会领袖带领。传道人被要求在多个村子和城镇之间巡回举行聚会，这样做可以鼓励信徒参加聚会。由于长期缺乏领袖，再加上农村的低识字率和缺乏圣经，农村家庭教会中慢慢出现了各种各样的问题，导致成千上万的信徒离弃了信仰。缺乏扎实的圣经教导也滋生了邪教和异端。一份报告强调了问题的严重性：
“对圣经的简单和字面解释，导致妇女们试图模仿旧约中关于亚伯拉罕和以撒的记述，把自己的儿子献祭。在盲目的信仰中，有些人试图像耶稣那样在水上行走，结果被淹死了。
对基督再来的渴望也引起了一些问题。浙江省的一间教会预言耶稣将会在1991年4月18日再来。于是，信徒荒废田地和庄稼，宰杀牲畜家禽吃掉。4月18日过去了，山坡上留下一群困惑和幻想破灭的男男女女，抬头凝望着天空。
1997年的风暴
1997年，温州市有400座教堂被政府拆毁，上图是一座教堂被拆毁前后的照片。
令人难以置信的是，温州市的“注册家庭教会”现象迅速发展到这种程度，到20世纪90年代中期，该市有2400多个教会注册为独立教会。有些教会的教堂可容纳数千人。
1996年4月，有迹象表明政府对温州教会的宽容政策很快就要结束，一名家庭教会的信徒因非法印刷基督教著作，在温州市附近被逮捕。他被公安人员殴打致死。另有两名男子被判处三年监禁。
1997年初，江泽民总书记显然对温州市数量众多的教堂深感震惊，每个教堂的顶上都装饰有一个红色的十字架。江泽民在大学就入党，并在毛泽东统治和文化大革命动乱时期获得晋升，温州人如此大胆地展示宗教信仰，对他来说是一种羞辱，是不可容忍的。
那年的晚些时候，国家宗教事务局接到指示，要减少这座城市的基督教形象。在11至12月一个为期六周的时间里，整个温州市有400多座教堂被夷为平地，超过50名牧师被捕。迫害迅速扩大至整个浙江省的其她家庭教会，一名牧师写了下面这封信：
“攻击中国教会的狂风暴雨越来越猛烈。自今年3月开始，我们就被吞没了，教会进入了一段极度痛苦的时期。许多教会领袖被捕，特别是在温州市、瑞安市、永嘉县（浙江省南部）、慈溪市、宁海县和洞头区（浙江省北部）。有些人遭受了肉身的痛苦。整个家庭不得不逃离。仅仅在瑞安市的一个小镇，就有32名家庭教会领袖被逮捕。其他的领袖都逃离了该地区
迫害甚至比文化大革命期间还严重。文化大革命的时候，他们至少是在户主在场的情况下搜家的。现在，即使主人不在，他们也会破门而入，把整个房子都翻个遍。他们开着警车，鸣着警笛，包围基督徒的家，就好像他们是强盗，把他们当作‘反革命分子’逮捕。请迫切为我们代祷。我现在被列入了逮捕名单，不得不离开家躲避。”
浙江省的迫害风暴慢慢减弱，因为政府将注意力转移到了其它事项上。然而，1998年初，温州市有数十名基督徒领袖被关进监狱，成千上万的信徒目睹他们的敬拜场所变成一片废墟。
宣教士遇阻
20世纪90年代，浙江省家庭教会第一次认真尝试差派宣教士到中国的其它地方，甚至其它国家去传福音。温州市的信徒很乐意走在前面，使用他们办企业所获得的财富和经验带头努力。1996年，一名教会领袖总结了温州市的基督身体达到这一步所经历的不同发展阶段：
“20世纪70年代的复兴开创了教会在我们地区的发展。20世纪80年代，很多人在家里聚会，有时候一个家里就有200多人聚会。因此，我们开始在每个区域建造教堂。
这十年的特点是向外省传福音和宣教。现在，我们教会差派的传道人去到了黑龙江、河南、湖南、广西、云南、安徽和江西等省区。我们每年都差派工人到这些省区。今年我们差派了40人，效果非常好。例如，在江西省有169人受洗。
我们把人差派到需要拓荒的地方。如果软弱的教会需要我们帮助，我们愿意去帮助他们。1995年初，我们差派工人到黑龙江省，在一个没有任何教会的地区建立了18间教会。但我们也帮助了38间已存教会。其中有一间教会刚开始只有约十名信徒，自从我们的工人去了之后，会众已经增长到200多人。”
到20世纪90年代中期，温州的教会差派了宣教士到中国与缅甸、俄罗斯接壤的少数民族地区，以及包括泰国和越南在内的好几个国家传福音。
可以预见的是，当温州的宣教士把福音传到中国的未得之地时，他们当中有很多人遭到了迫害，但令他们惊讶的是，他们还遇到了中国其它地区一些家庭教会的基督徒的抵制。当时，河南省巨大的家庭教会网络已经有数百万信徒，他们难以接受温州市的传道人。两者在教义和做法上都存在差别，甚至温州话与中国其它地方间的语言差别，也会产生误解。
温州工人所遇到的抵制，似乎主要是文化和社会方面的。温州基督徒通常受过较高的教育，商业成功，穿着考究。然而在河南省，因大能的复兴而进入神国的数百万信徒，在很大程度上都是穷人，是没有文化的农民。虽然双方彼此承认是基督的信徒，但在事工上并没有密切的联系。
来自河南省的一位著名家庭教会领袖坦率地分享了他当时对温州信徒的负面印象，他说：“温州的教会有很多属灵骄傲。他们认为自己是中国教会的核心和灵魂，从不能接受诸如河南和安徽等省份的基督徒比他们那里的基督徒多。”
来自河南省另一个家庭教会网络的一个姊妹也表达了同样的观点。当她被问及她对政府拆毁温州市数以百计的教堂的看法时，她回答说：
“我相信这是神的旨意。我看到大多数温州教会充满了骄傲。我1981年第一次去温州，此后几乎每年都去。早些年，温州教会极大地经历了主的祝福，但近年来，他们已变成律法主义者，并且以表现自己为导向。他们似乎对主很敞开，但实际上他们看不起来自河南省的牧师，自认为比别人强。教会领袖经常指着我们说：‘你们河南省的教会领袖未受过教导，怎么能来教导我们？我们做基督徒已经有一个多世纪了。你们应该来跟我们学习。’
根据我的经历，许多温州牧师都非常敬虔，他们很爱主。教会的教导是好的和正确的，只是他们没有从主领受到异象。他们的基础是正确的，但他们没有能力。没有从主那里领受到异象，是一个基督徒所能经历的最大痛苦。
温州市的许多基督徒都是富有的商人，他们花巨资建造教堂。我认为摧毁他们的教堂，是神给他们机会，让他们像最初那样跟随他。温州的教会会存活下来，但他们的建筑不会。如果温州的信徒经历我们河南信徒所经历的痛苦，福音将会在全国加倍地传扬。”